En chantier depuis 2004, le CHU Hôtel-Dieu entre dans une phase active de travaux en bord de Loire. Du coup, le quai Moncousu est entièrement fermé à la circulation jusqu'à la fin de l'année 2008. Outre le fait qu'elle rend impossible tout stationnement sur le secteur, cette fermeture a pour conséquence de modifier l'accès aux urgences. L'entrée habituelle du service ne change pas, mais il faudra dorénavant se présenter par la rue Gaston-Veil, face au pont Haudaudine, pour pouvoir y entrer. L'accès piéton au service pédiatrie est maintenu boulevard Jean-Monnet.
Concernant l'avancée des travaux, c'est la construction de l'Institut de recherche thérapeutique (IRT) qui est actuellement la plus spectaculaire. Le bâtiment de 12 000 m2, répartis sur huit étages face au fleuve, accueillera en janvier 2009 des équipes de recherche. Ce projet de 30 millions d'euros vise à répondre à la saturation de l'hôpital pour les chercheurs. Le pôle pédiatrique est lui concerné par un important programme de modernisation destiné à optimiser l'accueil et la prise en charge. De l'autre côté de l'IRT, la nouvelle hélistation est quasiment achevée et devrait être mise en service d'ici à un mois.