L'affaire des profanations du carré musulman a été transmise au pôle d'instruction de Béthune, compétent pour les affaires correctionnelles complexes (c'est le cas ici) et pour les affaires criminelles du ressort d'Arras. Selon le nouveau principe de collégialité de l'instruction, entré en vigueur au 1er mars 2008, elle est donc confiée à deux juges, qui portent un « regard croisé » sur l'instruction du dossier et décident ensemble des actes à mener.